维生素E的不良反应与很多因素有关，不是每个人都会发生，一般发生率很低，不要看到列了一大串不良反应就不敢用药了。在用药时出现不良反应，轻微而又需继续治疗的，可以一边治疗一边观察，同时向医师及药师咨询。较严重的或说明书没有记载的不良反应应立即停药到医院就诊，排除是不良反应还是出现新的病情。
1.有报道，长期用药(一日300mg以上)，可能引起高血压、荨麻疹、糖尿病及心绞痛加重，甚至可导致免疫功能下降及乳腺癌。长期大量(一日400～800mg)用药，可出现恶心、呕吐、头晕、头痛、眩晕、腹泻、胃痉挛、乏力软弱、视物模糊、乳腺肿大、流感样综合征、月经过多、闭经、低血糖等。偶有唇炎、口角炎及皮肤皲裂，停药后上述反应可逐渐消失。长期超剂量(一日大于800mg)用药，可影响内分泌功能(甲状腺、垂体和肾上腺)、性功能、免疫功能，易引起血小板聚积，并有出现血栓性静脉炎或栓塞的危险，维生素K缺乏者可引起出血倾向。
2.本药外用可引起接触性皮炎。
3.国外报道，本药可导致严重的肺栓塞、阴道出血、肠绞痛、肌无力及肌病(伴有血肌酸激酶升高)、创伤愈合速度减慢(动物实验)。